Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01852 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01852 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01852 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01852 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms