Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01808 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01808 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01808 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01808 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01808 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01808 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01808 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01808 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01808 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01808 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01808 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01808 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms