Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lancl1O89112 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms