Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms