Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd7O88665 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd7O88665 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd7O88665 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd7O88665 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd7O88665 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd7O88665 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms