Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmx1bO88609 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms