Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3bO88509 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms