Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl22O88430 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccl22O88430 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl22O88430 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms