Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp4O70480 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms