Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx7O70439 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms