Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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