Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx3O70137 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alx3O70137 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms