Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ldb2O55203 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ldb2O55203 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ldb2O55203 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ldb2O55203 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb2O55203 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ldb2O55203 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ldb2O55203 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ldb2O55203 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ldb2O55203 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb2O55203 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ldb2O55203 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms