Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx4O55187 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms