Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Copb2O55029 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Copb2O55029 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms