Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole2O54956 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole2O54956 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms