Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1baO35930 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp1baO35930 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp1baO35930 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms