Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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