Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Opn1mwO35599 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Opn1mwO35599 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Opn1mwO35599 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Opn1mwO35599 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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