Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Clk2O35491 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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