Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc27a2O35488 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms