Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna6O35345 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms