Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn9O35239 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms