Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smad6O35182 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smad6O35182 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms