Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc23O35125 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms