Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih2O35089 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih2O35089 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih2O35089 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih2O35089 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih2O35089 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih2O35089 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih2O35089 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih2O35089 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih2O35089 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih2O35089 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih2O35089 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms