Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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