Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra2O08842 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra2O08842 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms