Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms