Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf6O08584 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf6O08584 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms