Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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