Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MsmbO08540 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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