Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm20939L7N243 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20939L7N243 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20939L7N243 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm20939L7N243 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20939L7N243 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20939L7N243 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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