Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3542K7N6U2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3542K7N6U2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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