Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm21310J3QQ23 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm21310J3QQ23 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21310J3QQ23 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Gm21310J3QQ23 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21310J3QQ23 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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