Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms