Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8888J3QPX5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm8888J3QPX5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm8888J3QPX5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms