Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer2J3QPU5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms