Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms