Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21900J3QP38 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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