Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim18J3QNP2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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