Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20834J3QM72 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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