Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3727J3QM54 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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