Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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