Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms