Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r167G3UW71 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms