Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc37F8VPK0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc37F8VPK0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc37F8VPK0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms