Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Gm20538F6Z9R1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms