Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm10378F6XQQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms