Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms